diff --git a/R/templates/update_r_packages.sh.j2 b/R/templates/update_r_packages.sh.j2
index 207707e3..fd80698f 100644
--- a/R/templates/update_r_packages.sh.j2
+++ b/R/templates/update_r_packages.sh.j2
@@ -134,6 +134,7 @@ function get_data_files_from_svn() {
     if [ -d $R_PKGS_SVN_BASE_DIR/$R_PKGS_SVN_DIR ] ; then
         logger "update_r_packages: SVN update"
         cd $R_PKGS_SVN_BASE_DIR/$R_PKGS_SVN_DIR
+        SVN_CLEANUP_OP=$( svn cleanup )
         SVN_UPDATE_OP=$( svn update | tail -1 | grep Updated  >/dev/null 2>&1 )
         SVN_UPDATE_STATUS=$?
     else